Protein–RNA interactions for Protein: O09108

Lhb, Lutropin subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LhbO09108 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LhbO09108 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LhbO09108 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LhbO09108 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
LhbO09108 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
LhbO09108 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LhbO09108 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LhbO09108 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LhbO09108 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LhbO09108 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LhbO09108 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LhbO09108 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LhbO09108 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LhbO09108 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LhbO09108 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LhbO09108 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LhbO09108 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LhbO09108 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LhbO09108 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LhbO09108 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LhbO09108 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LhbO09108 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LhbO09108 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LhbO09108 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LhbO09108 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LhbO09108 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LhbO09108 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LhbO09108 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LhbO09108 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LhbO09108 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LhbO09108 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LhbO09108 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LhbO09108 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LhbO09108 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LhbO09108 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LhbO09108 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LhbO09108 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LhbO09108 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
LhbO09108 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LhbO09108 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LhbO09108 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LhbO09108 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LhbO09108 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LhbO09108 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LhbO09108 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LhbO09108 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LhbO09108 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LhbO09108 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LhbO09108 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LhbO09108 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
LhbO09108 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
LhbO09108 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
LhbO09108 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LhbO09108 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
LhbO09108 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
LhbO09108 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
LhbO09108 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LhbO09108 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LhbO09108 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
LhbO09108 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
LhbO09108 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
LhbO09108 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LhbO09108 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LhbO09108 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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LhbO09108 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LhbO09108 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LhbO09108 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LhbO09108 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LhbO09108 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LhbO09108 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
LhbO09108 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LhbO09108 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LhbO09108 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LhbO09108 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LhbO09108 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LhbO09108 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LhbO09108 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LhbO09108 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LhbO09108 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LhbO09108 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LhbO09108 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LhbO09108 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LhbO09108 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LhbO09108 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LhbO09108 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LhbO09108 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LhbO09108 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LhbO09108 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LhbO09108 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
LhbO09108 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LhbO09108 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LhbO09108 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LhbO09108 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
LhbO09108 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
LhbO09108 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms