Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

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Length 521 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Gm13437-201ENSMUST00000122434 1981 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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PrkcshO08795 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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PrkcshO08795 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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PrkcshO08795 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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PrkcshO08795 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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PrkcshO08795 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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PrkcshO08795 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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PrkcshO08795 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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PrkcshO08795 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Gm5860-202ENSMUST00000151038 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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PrkcshO08795 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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PrkcshO08795 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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PrkcshO08795 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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PrkcshO08795 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Vrk1-204ENSMUST00000220629 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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PrkcshO08795 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 8030423F21Rik-201ENSMUST00000064097 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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