Protein–RNA interactions for Protein: O08736

Casp12, Caspase-12, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp12O08736 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casp12O08736 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casp12O08736 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Casp12O08736 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp12O08736 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp12O08736 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp12O08736 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp12O08736 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp12O08736 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp12O08736 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp12O08736 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp12O08736 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp12O08736 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp12O08736 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp12O08736 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp12O08736 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp12O08736 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp12O08736 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp12O08736 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp12O08736 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp12O08736 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp12O08736 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp12O08736 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp12O08736 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp12O08736 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp12O08736 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp12O08736 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp12O08736 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp12O08736 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp12O08736 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp12O08736 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp12O08736 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp12O08736 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp12O08736 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp12O08736 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp12O08736 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp12O08736 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp12O08736 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casp12O08736 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casp12O08736 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casp12O08736 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Casp12O08736 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casp12O08736 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casp12O08736 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casp12O08736 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casp12O08736 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casp12O08736 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casp12O08736 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casp12O08736 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casp12O08736 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casp12O08736 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casp12O08736 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casp12O08736 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casp12O08736 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casp12O08736 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casp12O08736 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casp12O08736 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Casp12O08736 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casp12O08736 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casp12O08736 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Casp12O08736 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Casp12O08736 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casp12O08736 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Casp12O08736 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Casp12O08736 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casp12O08736 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms