Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
MsmbO08540 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
MsmbO08540 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
MsmbO08540 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
MsmbO08540 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
MsmbO08540 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
MsmbO08540 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
MsmbO08540 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
MsmbO08540 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
MsmbO08540 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
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