Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

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Length 103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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