Protein–RNA interactions for Protein: K7N746

Gm2888, Predicted gene 2888, mousemouse

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Length 267 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2888K7N746 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm2888K7N746 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm2888K7N746 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm2888K7N746 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm2888K7N746 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm2888K7N746 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm2888K7N746 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm2888K7N746 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm2888K7N746 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm2888K7N746 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm2888K7N746 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm2888K7N746 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm2888K7N746 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm2888K7N746 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm2888K7N746 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm2888K7N746 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm2888K7N746 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm2888K7N746 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm2888K7N746 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm2888K7N746 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm2888K7N746 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm2888K7N746 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm2888K7N746 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm2888K7N746 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm2888K7N746 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm2888K7N746 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm2888K7N746 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm2888K7N746 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm2888K7N746 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm2888K7N746 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm2888K7N746 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm2888K7N746 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm2888K7N746 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm2888K7N746 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm2888K7N746 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm2888K7N746 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm2888K7N746 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm2888K7N746 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm2888K7N746 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm2888K7N746 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm2888K7N746 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm2888K7N746 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm2888K7N746 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm2888K7N746 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm2888K7N746 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm2888K7N746 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm2888K7N746 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm2888K7N746 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm2888K7N746 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm2888K7N746 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm2888K7N746 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm2888K7N746 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm2888K7N746 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm2888K7N746 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm2888K7N746 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm2888K7N746 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm2888K7N746 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm2888K7N746 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm2888K7N746 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm2888K7N746 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm2888K7N746 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gm2888K7N746 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gm2888K7N746 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm2888K7N746 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm2888K7N746 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm2888K7N746 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm2888K7N746 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm2888K7N746 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Gm2888K7N746 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm2888K7N746 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm2888K7N746 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm2888K7N746 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm2888K7N746 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
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Gm2888K7N746 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm2888K7N746 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm2888K7N746 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm2888K7N746 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm2888K7N746 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm2888K7N746 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm2888K7N746 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm2888K7N746 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm2888K7N746 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm2888K7N746 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm2888K7N746 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm2888K7N746 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm2888K7N746 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm2888K7N746 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm2888K7N746 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm2888K7N746 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm2888K7N746 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm2888K7N746 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm2888K7N746 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm2888K7N746 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm2888K7N746 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm2888K7N746 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm2888K7N746 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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