Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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Gm21887J3QQ04 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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Gm21887J3QQ04 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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Gm21887J3QQ04 Csnk1d-202ENSMUST00000070575 3500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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Gm21887J3QQ04 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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Gm21887J3QQ04 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Gm6640-201ENSMUST00000120629 1587 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Metap2-210ENSMUST00000181217 1984 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
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