Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms