Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm2035J3QP87 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms