Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.7 ms