Protein–RNA interactions for Protein: J3QP37

Smim22, MCG1038270, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim22J3QP37 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim22J3QP37 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim22J3QP37 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim22J3QP37 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim22J3QP37 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim22J3QP37 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim22J3QP37 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim22J3QP37 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim22J3QP37 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim22J3QP37 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim22J3QP37 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim22J3QP37 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim22J3QP37 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim22J3QP37 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim22J3QP37 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim22J3QP37 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim22J3QP37 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim22J3QP37 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim22J3QP37 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim22J3QP37 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim22J3QP37 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim22J3QP37 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim22J3QP37 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim22J3QP37 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim22J3QP37 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim22J3QP37 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim22J3QP37 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim22J3QP37 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim22J3QP37 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim22J3QP37 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim22J3QP37 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim22J3QP37 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim22J3QP37 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim22J3QP37 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim22J3QP37 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim22J3QP37 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim22J3QP37 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim22J3QP37 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim22J3QP37 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim22J3QP37 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim22J3QP37 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim22J3QP37 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim22J3QP37 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim22J3QP37 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim22J3QP37 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim22J3QP37 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim22J3QP37 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim22J3QP37 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim22J3QP37 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim22J3QP37 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim22J3QP37 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim22J3QP37 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim22J3QP37 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim22J3QP37 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim22J3QP37 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim22J3QP37 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim22J3QP37 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim22J3QP37 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim22J3QP37 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim22J3QP37 Gm6630-201ENSMUST00000119199 454 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim22J3QP37 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim22J3QP37 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim22J3QP37 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim22J3QP37 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim22J3QP37 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim22J3QP37 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Smim22J3QP37 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim22J3QP37 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim22J3QP37 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim22J3QP37 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim22J3QP37 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim22J3QP37 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim22J3QP37 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim22J3QP37 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim22J3QP37 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim22J3QP37 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim22J3QP37 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim22J3QP37 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim22J3QP37 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim22J3QP37 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim22J3QP37 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim22J3QP37 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim22J3QP37 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim22J3QP37 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim22J3QP37 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim22J3QP37 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim22J3QP37 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim22J3QP37 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim22J3QP37 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim22J3QP37 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim22J3QP37 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim22J3QP37 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms