Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3415J3QMS8 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Gm3415J3QMS8 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Gm3415J3QMS8 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Gm3415J3QMS8 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Gm3415J3QMS8 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Gm3415J3QMS8 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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