Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21060J3KMU4 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms