Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms