Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Taf4bG5E8Z2 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Taf4bG5E8Z2 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms