Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arfgef1G3X9K3 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Arfgef1G3X9K3 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arfgef1G3X9K3 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arfgef1G3X9K3 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Arfgef1G3X9K3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arfgef1G3X9K3 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arfgef1G3X9K3 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arfgef1G3X9K3 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arfgef1G3X9K3 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arfgef1G3X9K3 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arfgef1G3X9K3 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arfgef1G3X9K3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arfgef1G3X9K3 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arfgef1G3X9K3 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arfgef1G3X9K3 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arfgef1G3X9K3 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arfgef1G3X9K3 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arfgef1G3X9K3 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arfgef1G3X9K3 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arfgef1G3X9K3 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arfgef1G3X9K3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arfgef1G3X9K3 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arfgef1G3X9K3 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arfgef1G3X9K3 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arfgef1G3X9K3 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arfgef1G3X9K3 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arfgef1G3X9K3 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfgef1G3X9K3 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfgef1G3X9K3 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfgef1G3X9K3 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfgef1G3X9K3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfgef1G3X9K3 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfgef1G3X9K3 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfgef1G3X9K3 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfgef1G3X9K3 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfgef1G3X9K3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfgef1G3X9K3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfgef1G3X9K3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfgef1G3X9K3 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfgef1G3X9K3 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfgef1G3X9K3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfgef1G3X9K3 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfgef1G3X9K3 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfgef1G3X9K3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfgef1G3X9K3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfgef1G3X9K3 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfgef1G3X9K3 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfgef1G3X9K3 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfgef1G3X9K3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfgef1G3X9K3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfgef1G3X9K3 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfgef1G3X9K3 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfgef1G3X9K3 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfgef1G3X9K3 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfgef1G3X9K3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfgef1G3X9K3 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfgef1G3X9K3 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfgef1G3X9K3 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfgef1G3X9K3 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfgef1G3X9K3 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfgef1G3X9K3 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfgef1G3X9K3 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfgef1G3X9K3 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfgef1G3X9K3 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfgef1G3X9K3 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfgef1G3X9K3 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfgef1G3X9K3 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfgef1G3X9K3 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfgef1G3X9K3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfgef1G3X9K3 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arfgef1G3X9K3 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arfgef1G3X9K3 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arfgef1G3X9K3 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arfgef1G3X9K3 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arfgef1G3X9K3 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arfgef1G3X9K3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arfgef1G3X9K3 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arfgef1G3X9K3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arfgef1G3X9K3 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Arfgef1G3X9K3 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Arfgef1G3X9K3 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arfgef1G3X9K3 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Arfgef1G3X9K3 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Arfgef1G3X9K3 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Arfgef1G3X9K3 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Arfgef1G3X9K3 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arfgef1G3X9K3 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arfgef1G3X9K3 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arfgef1G3X9K3 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arfgef1G3X9K3 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arfgef1G3X9K3 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arfgef1G3X9K3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arfgef1G3X9K3 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arfgef1G3X9K3 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arfgef1G3X9K3 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arfgef1G3X9K3 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arfgef1G3X9K3 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arfgef1G3X9K3 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arfgef1G3X9K3 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms