Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Sult1e1-201ENSMUST00000031201 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Ndufc1-201ENSMUST00000038108 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Gm40263-201ENSMUST00000197468 580 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Gm45072-201ENSMUST00000208673 929 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 2310061N02Rik-201ENSMUST00000050882 794 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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