Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm8005F6YKY3 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm8005F6YKY3 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm8005F6YKY3 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm8005F6YKY3 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm8005F6YKY3 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8005F6YKY3 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8005F6YKY3 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8005F6YKY3 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8005F6YKY3 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8005F6YKY3 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8005F6YKY3 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8005F6YKY3 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8005F6YKY3 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8005F6YKY3 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8005F6YKY3 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8005F6YKY3 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8005F6YKY3 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8005F6YKY3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8005F6YKY3 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8005F6YKY3 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8005F6YKY3 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8005F6YKY3 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8005F6YKY3 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8005F6YKY3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8005F6YKY3 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8005F6YKY3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8005F6YKY3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8005F6YKY3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Gm8005F6YKY3 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8005F6YKY3 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8005F6YKY3 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Gm8005F6YKY3 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8005F6YKY3 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8005F6YKY3 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8005F6YKY3 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8005F6YKY3 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8005F6YKY3 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8005F6YKY3 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8005F6YKY3 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8005F6YKY3 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8005F6YKY3 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8005F6YKY3 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8005F6YKY3 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8005F6YKY3 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8005F6YKY3 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8005F6YKY3 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8005F6YKY3 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8005F6YKY3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm8005F6YKY3 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm8005F6YKY3 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm8005F6YKY3 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm8005F6YKY3 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm8005F6YKY3 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm8005F6YKY3 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm8005F6YKY3 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm8005F6YKY3 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm8005F6YKY3 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm8005F6YKY3 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm8005F6YKY3 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm8005F6YKY3 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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