Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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