Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmod3E9QA62 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms