Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Myo5cE9Q1F5 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms