Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms