Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Gm31314-201ENSMUST00000201435 609 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Uqcrc2-201ENSMUST00000033176 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Gm15746-201ENSMUST00000120684 1027 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 891 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Blvra-202ENSMUST00000110389 657 ntTSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Izumo1r-202ENSMUST00000069408 1172 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Gm37197-201ENSMUST00000195607 401 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Mt1-203ENSMUST00000212291 633 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Psca-201ENSMUST00000023265 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms