Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syde2E9PUP1 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.9 ms