Protein–RNA interactions for Protein: E0CXF8

BC035044, cDNA sequence BC035044, mousemouse

Predictions only

Length 138 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC035044E0CXF8 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
BC035044E0CXF8 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
BC035044E0CXF8 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BC035044E0CXF8 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BC035044E0CXF8 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BC035044E0CXF8 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BC035044E0CXF8 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
BC035044E0CXF8 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BC035044E0CXF8 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BC035044E0CXF8 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BC035044E0CXF8 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
BC035044E0CXF8 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BC035044E0CXF8 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BC035044E0CXF8 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BC035044E0CXF8 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BC035044E0CXF8 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BC035044E0CXF8 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
BC035044E0CXF8 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BC035044E0CXF8 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BC035044E0CXF8 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BC035044E0CXF8 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
BC035044E0CXF8 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BC035044E0CXF8 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BC035044E0CXF8 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BC035044E0CXF8 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BC035044E0CXF8 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
BC035044E0CXF8 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BC035044E0CXF8 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BC035044E0CXF8 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
BC035044E0CXF8 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BC035044E0CXF8 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
BC035044E0CXF8 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BC035044E0CXF8 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BC035044E0CXF8 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
BC035044E0CXF8 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BC035044E0CXF8 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
BC035044E0CXF8 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
BC035044E0CXF8 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
BC035044E0CXF8 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
BC035044E0CXF8 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BC035044E0CXF8 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BC035044E0CXF8 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
BC035044E0CXF8 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BC035044E0CXF8 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BC035044E0CXF8 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
BC035044E0CXF8 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BC035044E0CXF8 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BC035044E0CXF8 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
BC035044E0CXF8 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BC035044E0CXF8 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
BC035044E0CXF8 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BC035044E0CXF8 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BC035044E0CXF8 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BC035044E0CXF8 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC035044E0CXF8 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC035044E0CXF8 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC035044E0CXF8 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC035044E0CXF8 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC035044E0CXF8 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
BC035044E0CXF8 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC035044E0CXF8 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC035044E0CXF8 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC035044E0CXF8 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC035044E0CXF8 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC035044E0CXF8 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC035044E0CXF8 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC035044E0CXF8 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC035044E0CXF8 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC035044E0CXF8 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC035044E0CXF8 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC035044E0CXF8 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC035044E0CXF8 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
BC035044E0CXF8 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC035044E0CXF8 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC035044E0CXF8 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC035044E0CXF8 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC035044E0CXF8 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
BC035044E0CXF8 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC035044E0CXF8 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC035044E0CXF8 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC035044E0CXF8 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC035044E0CXF8 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC035044E0CXF8 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC035044E0CXF8 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC035044E0CXF8 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC035044E0CXF8 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
BC035044E0CXF8 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC035044E0CXF8 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC035044E0CXF8 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC035044E0CXF8 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC035044E0CXF8 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC035044E0CXF8 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC035044E0CXF8 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC035044E0CXF8 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms