Protein–RNA interactions for Protein: D3YZZ2

Tgfbr3l, Transforming growth factor, beta receptor III-like, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr3lD3YZZ2 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms