Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc6D3YZP9 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms