Protein–RNA interactions for Protein: D3YU81

Rfx8, DNA-binding protein RFX8, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx8D3YU81 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rfx8D3YU81 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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