Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cttnbp2B9EJA2 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms