Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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