Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Apba1B2RUJ5 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apba1B2RUJ5 Olfr921-201ENSMUST00000071681 1181 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apba1B2RUJ5 Olfr995-201ENSMUST00000099924 1113 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apba1B2RUJ5 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apba1B2RUJ5 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apba1B2RUJ5 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apba1B2RUJ5 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apba1B2RUJ5 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apba1B2RUJ5 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apba1B2RUJ5 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apba1B2RUJ5 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apba1B2RUJ5 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apba1B2RUJ5 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apba1B2RUJ5 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apba1B2RUJ5 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apba1B2RUJ5 Timm21-201ENSMUST00000025547 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apba1B2RUJ5 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apba1B2RUJ5 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Gm15882-201ENSMUST00000161344 855 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Gm19253-201ENSMUST00000204279 307 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 AC116589.4-201ENSMUST00000222390 216 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 AC154441.1-201ENSMUST00000223653 1006 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 A530046M15Rik-201ENSMUST00000221778 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Gm12601-201ENSMUST00000118994 846 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Csn2-204ENSMUST00000196869 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Gm45276-201ENSMUST00000209549 1086 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms