Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprbB2RU80 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
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PtprbB2RU80 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
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PtprbB2RU80 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
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PtprbB2RU80 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
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PtprbB2RU80 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
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PtprbB2RU80 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
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PtprbB2RU80 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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PtprbB2RU80 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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PtprbB2RU80 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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PtprbB2RU80 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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PtprbB2RU80 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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PtprbB2RU80 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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