Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms