Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms