Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Grik3B1AS29 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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