Protein–RNA interactions for Protein: A3KG59

Pm20d2, Peptidase M20 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pm20d2A3KG59 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Pm20d2A3KG59 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Pm20d2A3KG59 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pm20d2A3KG59 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Pm20d2A3KG59 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pm20d2A3KG59 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pm20d2A3KG59 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pm20d2A3KG59 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pm20d2A3KG59 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pm20d2A3KG59 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pm20d2A3KG59 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pm20d2A3KG59 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pm20d2A3KG59 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pm20d2A3KG59 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pm20d2A3KG59 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Pm20d2A3KG59 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pm20d2A3KG59 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pm20d2A3KG59 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pm20d2A3KG59 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pm20d2A3KG59 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pm20d2A3KG59 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pm20d2A3KG59 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pm20d2A3KG59 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pm20d2A3KG59 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pm20d2A3KG59 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pm20d2A3KG59 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pm20d2A3KG59 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pm20d2A3KG59 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pm20d2A3KG59 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pm20d2A3KG59 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pm20d2A3KG59 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pm20d2A3KG59 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pm20d2A3KG59 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pm20d2A3KG59 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pm20d2A3KG59 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pm20d2A3KG59 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pm20d2A3KG59 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pm20d2A3KG59 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pm20d2A3KG59 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pm20d2A3KG59 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pm20d2A3KG59 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pm20d2A3KG59 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pm20d2A3KG59 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pm20d2A3KG59 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pm20d2A3KG59 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pm20d2A3KG59 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pm20d2A3KG59 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pm20d2A3KG59 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pm20d2A3KG59 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pm20d2A3KG59 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pm20d2A3KG59 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pm20d2A3KG59 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pm20d2A3KG59 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pm20d2A3KG59 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pm20d2A3KG59 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pm20d2A3KG59 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pm20d2A3KG59 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pm20d2A3KG59 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pm20d2A3KG59 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pm20d2A3KG59 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pm20d2A3KG59 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pm20d2A3KG59 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pm20d2A3KG59 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pm20d2A3KG59 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pm20d2A3KG59 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pm20d2A3KG59 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pm20d2A3KG59 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pm20d2A3KG59 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pm20d2A3KG59 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pm20d2A3KG59 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pm20d2A3KG59 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pm20d2A3KG59 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pm20d2A3KG59 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pm20d2A3KG59 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pm20d2A3KG59 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pm20d2A3KG59 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pm20d2A3KG59 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pm20d2A3KG59 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pm20d2A3KG59 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pm20d2A3KG59 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pm20d2A3KG59 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pm20d2A3KG59 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pm20d2A3KG59 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pm20d2A3KG59 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pm20d2A3KG59 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pm20d2A3KG59 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pm20d2A3KG59 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pm20d2A3KG59 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pm20d2A3KG59 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pm20d2A3KG59 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pm20d2A3KG59 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pm20d2A3KG59 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pm20d2A3KG59 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pm20d2A3KG59 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pm20d2A3KG59 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pm20d2A3KG59 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pm20d2A3KG59 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pm20d2A3KG59 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pm20d2A3KG59 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pm20d2A3KG59 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms