Protein–RNA interactions for Protein: A2RT81

Rnf39, MCG22610, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf39A2RT81 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf39A2RT81 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms