Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Samt1A2BED8 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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