Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syndig1A2ANU3 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms