Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GabreA2AMW3 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GabreA2AMW3 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GabreA2AMW3 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GabreA2AMW3 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GabreA2AMW3 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GabreA2AMW3 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GabreA2AMW3 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GabreA2AMW3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GabreA2AMW3 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GabreA2AMW3 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GabreA2AMW3 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GabreA2AMW3 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GabreA2AMW3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GabreA2AMW3 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GabreA2AMW3 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GabreA2AMW3 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GabreA2AMW3 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GabreA2AMW3 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GabreA2AMW3 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GabreA2AMW3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GabreA2AMW3 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GabreA2AMW3 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GabreA2AMW3 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GabreA2AMW3 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GabreA2AMW3 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GabreA2AMW3 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GabreA2AMW3 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GabreA2AMW3 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GabreA2AMW3 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GabreA2AMW3 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GabreA2AMW3 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GabreA2AMW3 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GabreA2AMW3 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GabreA2AMW3 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GabreA2AMW3 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GabreA2AMW3 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GabreA2AMW3 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GabreA2AMW3 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GabreA2AMW3 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GabreA2AMW3 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GabreA2AMW3 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GabreA2AMW3 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GabreA2AMW3 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GabreA2AMW3 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GabreA2AMW3 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GabreA2AMW3 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GabreA2AMW3 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GabreA2AMW3 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GabreA2AMW3 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GabreA2AMW3 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GabreA2AMW3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GabreA2AMW3 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GabreA2AMW3 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GabreA2AMW3 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GabreA2AMW3 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GabreA2AMW3 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GabreA2AMW3 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GabreA2AMW3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GabreA2AMW3 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GabreA2AMW3 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms