Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms