Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

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Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prdm12A2AJ77 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Prdm12A2AJ77 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prdm12A2AJ77 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prdm12A2AJ77 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prdm12A2AJ77 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prdm12A2AJ77 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prdm12A2AJ77 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Prdm12A2AJ77 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Prdm12A2AJ77 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prdm12A2AJ77 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prdm12A2AJ77 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prdm12A2AJ77 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prdm12A2AJ77 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prdm12A2AJ77 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prdm12A2AJ77 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Prdm12A2AJ77 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prdm12A2AJ77 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prdm12A2AJ77 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prdm12A2AJ77 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prdm12A2AJ77 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prdm12A2AJ77 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prdm12A2AJ77 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prdm12A2AJ77 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prdm12A2AJ77 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prdm12A2AJ77 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Prdm12A2AJ77 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prdm12A2AJ77 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prdm12A2AJ77 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prdm12A2AJ77 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prdm12A2AJ77 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prdm12A2AJ77 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prdm12A2AJ77 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prdm12A2AJ77 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Prdm12A2AJ77 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prdm12A2AJ77 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Prdm12A2AJ77 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prdm12A2AJ77 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prdm12A2AJ77 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prdm12A2AJ77 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Prdm12A2AJ77 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prdm12A2AJ77 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prdm12A2AJ77 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prdm12A2AJ77 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prdm12A2AJ77 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prdm12A2AJ77 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prdm12A2AJ77 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prdm12A2AJ77 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prdm12A2AJ77 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prdm12A2AJ77 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prdm12A2AJ77 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prdm12A2AJ77 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prdm12A2AJ77 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prdm12A2AJ77 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prdm12A2AJ77 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prdm12A2AJ77 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prdm12A2AJ77 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prdm12A2AJ77 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prdm12A2AJ77 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Prdm12A2AJ77 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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Prdm12A2AJ77 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Prdm12A2AJ77 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prdm12A2AJ77 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Prdm12A2AJ77 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prdm12A2AJ77 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prdm12A2AJ77 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prdm12A2AJ77 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prdm12A2AJ77 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prdm12A2AJ77 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prdm12A2AJ77 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prdm12A2AJ77 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prdm12A2AJ77 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Prdm12A2AJ77 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prdm12A2AJ77 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prdm12A2AJ77 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prdm12A2AJ77 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prdm12A2AJ77 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prdm12A2AJ77 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prdm12A2AJ77 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prdm12A2AJ77 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prdm12A2AJ77 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prdm12A2AJ77 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prdm12A2AJ77 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prdm12A2AJ77 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prdm12A2AJ77 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Prdm12A2AJ77 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prdm12A2AJ77 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prdm12A2AJ77 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Prdm12A2AJ77 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms