Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ambra1A2AH22 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms