Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Frmpd4A2AFR3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms