Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb4A2A863 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb4A2A863 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb4A2A863 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb4A2A863 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb4A2A863 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb4A2A863 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb4A2A863 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb4A2A863 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb4A2A863 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb4A2A863 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb4A2A863 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb4A2A863 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb4A2A863 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb4A2A863 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb4A2A863 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb4A2A863 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb4A2A863 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb4A2A863 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb4A2A863 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb4A2A863 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb4A2A863 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb4A2A863 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb4A2A863 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb4A2A863 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb4A2A863 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb4A2A863 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb4A2A863 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb4A2A863 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb4A2A863 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb4A2A863 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb4A2A863 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb4A2A863 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb4A2A863 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb4A2A863 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb4A2A863 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb4A2A863 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb4A2A863 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb4A2A863 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb4A2A863 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb4A2A863 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb4A2A863 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb4A2A863 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb4A2A863 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb4A2A863 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb4A2A863 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb4A2A863 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb4A2A863 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb4A2A863 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb4A2A863 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb4A2A863 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb4A2A863 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb4A2A863 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb4A2A863 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb4A2A863 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb4A2A863 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb4A2A863 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb4A2A863 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb4A2A863 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb4A2A863 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb4A2A863 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb4A2A863 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb4A2A863 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb4A2A863 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb4A2A863 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb4A2A863 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb4A2A863 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb4A2A863 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb4A2A863 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb4A2A863 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb4A2A863 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb4A2A863 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb4A2A863 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb4A2A863 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb4A2A863 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb4A2A863 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb4A2A863 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb4A2A863 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb4A2A863 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb4A2A863 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb4A2A863 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb4A2A863 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb4A2A863 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb4A2A863 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb4A2A863 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb4A2A863 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb4A2A863 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms