Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Calcoco2A2A6M5 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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