Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lrit3W8DXL4 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms