Protein–RNA interactions for Protein: V9GXR0

H2-Bl, Histocompatibility 2, blastocyst, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-BlV9GXR0 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-BlV9GXR0 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms