Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vstm4T1NXB5 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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