Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
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Ubl3Q9Z2M6 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Ubl3Q9Z2M6 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Ubl3Q9Z2M6 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Ubl3Q9Z2M6 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Ubl3Q9Z2M6 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ubl3Q9Z2M6 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Ubl3Q9Z2M6 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Ubl3Q9Z2M6 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ubl3Q9Z2M6 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
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